Модуль микробиологической лаборатории (#74920, в работе)

Работа в модуле микробиологической лаборатории состоит из:

1. Настройка анализа
   
2. Работа с документами
3. Отчеты для проверки справочников и документов
4. Заполнение анкеты бак лаборатории для заполнения справочника

1. Настройка анализа

1.1 Справочник "Лаборатории ЛПУ"

В справочнике "Лаборатории ЛПУ" (Рис.1 п. 1) должна быть лаборатория с признаком «бактериологическая» (Рис. 2) - то есть установлена галочка у признака "Лаборатория бактериологическая" .

Для того, чтобы открыть справочник, последовательно нажмите - Справочники (2) - Лаборатория (3) - Лаборатории ЛПУ (4)

Рисунок 1.

Рисунок 1.

Если такой лаборатории нет, то её следует добавить. Для этого в справочнике "Лаборатории ЛПУ" нажмите на плюс (Рис. 3 п. 1), в открывшемся окне новой лаборатории укажите:

• Наименование лаборатории (2)
• Отделение, к которому она относится (3)
• Признак "Лаборатория бактериологическая" (4)
• Нажмите "Сохранить и закрыть" для завершения создания новой лаборатории в справочнике (5)

Рисунок 3.

 1.2 Справочник "Исследования лаборатории"

В этом справочнике настраиваются анализы и исследования, выполняемые в лаборатории. Для настройки микробиологических анализов достаточно для каждого исследуемого биоматериала создать анализ, в анализе указать (создать новое) исследование, и в исследовании указать один параметр (параметр рекомендуем назвать идентично биоматериалу, но не обязательно). Более подробно создание анализов, исследований и параметров описано в инструкции о пошаговой настройке анализов.

При создании анализа все элементы должны относиться именно к бактериологической лаборатории:

Рисунок 4.

В анализе обязательно должны быть указаны:

• Лаборатория
• Вид исследования
• Услуга федеральная
• Биоматериал
• Федеральная услуга по сбору биоматериала
• Количество доставляемого биоматериала
• Контейнер для сбора биоматериала

Вид исследования, биоматериал, единицы измерения доставляемого объёма биоматериала (указывается в настройках биоматериала) должны быть сопоставлены с федеральными справочниками. Подробнее в инструкции по сопоставлению с федеральными справочниками.

Если при обнаружении микроорганизма указывается степень роста, можно настроить список возможных значений, для того, чтобы не вносить каждый раз информацию вручную. Инструкцию по созданию списков значений можно посмотреть тут.

1.3 Справочники Бактериологии

Если анализ подразумевает обнаружение конкретных микроорганизмов, их можно указать в параметре созданного анализа на вкладке "Микроорганизмы" (Рис. 6 п. 1). Таким образом при заполнении протокола микробиологического исследования сотруднику не нужно будет искать микроорганизм в справочнике, а достаточно будет выбрать из настроенного списка. Для этого необходимо открыть параметр, последовательно выбрав в справочнике исследований анализ (Рис. 5 п. 1), исследование (Рис. 5 п. 2), параметр (Рис. 5 п. 3), в параметре перейти на вкладку «Микроорганизмы» (Рис. 6 п. 1) и заполнить табличную часть из справочника (Рис. 6 п. 2).

Рисунок 5.

Рисунок 11.

Для добавления микроорганизма нажмите на плюс (Рис. 6 п. 3), откроется справочник микроорганизмов (Рис. 7 ) (https://nsi.rosminzdrav.ru/dictionaries/1.2.643.5.1.13.13.11.1087/passport/latest )

Рисунок 7.

Структура справочника:

1. Микроорганизмы справочника, доступные для выбора.
2. Таксономические категории микроорганизмов.
3. Поиск группы, к которой относится микроорганизм.
4. Поиск микроорганизма в справочнике по наименованию.
5. Поиск микроорганизмов по наименованию анализа. Для этого в параметре анализа должны быть указаны микроорганизмы (Рис. 6)
6. Отобразить неиспользуемые - при включении этой галочки в справочнике отображаются все микроорганизмы, в том числе помеченные, как неиспользуемые. Если галочка не установлена, отображаются только используемые микроорганизмы.

В табличной части отображаются все микроорганизмы (Рис. 8), но можно включить отображение содержимого выбранной группы (Рис. 9)

Рисунок 8.

Рисунок 8.

Далее выбираете левой кнопкой мыши микроорганизм, который хотите добавить, и нажимаете "Выбрать" (Рис. 7 п. 7).

Для настройки или редактирования выбранного микроорганизма, нажмите на лупу:

Рисунок 10.

Откроется карточка микроорганизма:

Рисунок 11.

1. Код - Если создавать микроорганизм вручную, генерируется автоматически, если микроорганизм загружен из НСИ - соответствует коду НСИ МЗ РФ
2. Принадлежность микроорганизма к справочнику грибов или бактерий
3. Наименование микроорганизма - загружено из справочника
4. Таксономическая категория - класс, тип, порядок, семейство, род или вид, к которому относится микроорганизм
5. Окраска по Граму
6. Принадлежность - пустое значение, кокки, палочки, извитые
   
7. Синонимы – заполнено из НСИ

8. Вызываемое заболевание – заполнено в соответствии с СП 1.3.3118-13.

9. Сопоставление с федеральным справочником НСИ

10. Флаг «не используется» - устанавливается, если данный элемент справочника не планируется использовать в работе лаборатории. Микроорганизм, помеченный этим флагом, будет скрыт.

11. Группа патогенности - четыре основные группы, отражающие степень опасности для человека и общества в случае инфицирования
12. Код НСИ МЗ РФ- заполнено из НСИ
13. Индекс сортировки - заполнено из НСИ
14. Вкладки для настройки микроорганизма:

• Контейнеры - табличная часть, в которой можно указать контейнеры или транспортные среды, используемые для доставки биоматериала с этим микроорганизмом в лабораторию. Контейнеры выбираются из справочника «Контейнеры, транспортные среды». Более подробно о контейнерах описано в инструкции Настройка биоматериала и контейнеров.
• Антибиотики - можно указать препараты, к которым для данного микроорганизма проводится определение чувствительности
• Общие антибиотики организмов входящие в эту категорию - настройки антибиотиков для всей таксономической категории. При настройке категории можно указать на этой вкладке перечень препаратов, и указанный список будет распространяться на все микроорганизмы, относящиеся к данной категории.
  
  Если у одного или нескольких микроорганизмов поставить признак «По умолчанию», такие микроорганизмы будут автоматически добавляться в протокол лабораторного исследования при установлении статуса "микроорганизм обнаружен" (Рис. 12 п. 2)

Рисунок 12.

Без антибиотиков (Рис. 12 п. 1) - Даже при настроенных внутри карточки микроорганизма антибиотиков по умолчанию, именно в этом анализе автоматически не заполняет табличную часть с антибиотиками.

Индекс сортировки - (Рис. 12 п. 3) - Порядок сортировки в таблице микроорганизмов в протоколе лабораторного исследования:

Рисунок 13.

Для каждого микроорганизма можно указать список антибиотиков, к которым при обнаружении будет проводиться определение чувствительности, не придётся искать нужный препарат в огромном списке – он будет ограничен данной настройкой. Для добавления антибиотика выберите микроорганизм левой кнопкой мыши (Рис. 14 п. 1), нажмите на лупу (2), откроется карточка микроорганизма, перейдите на вкладку "Антибиотики" (3) и нажмите на плюс (4).

Рисунок 14.

В открывшемся справочнике антибиотиков (https://nsi.rosminzdrav.ru/dictionaries/1.2.643.5.1.13.13.99.2.1095/passport/latest) выберите нужный левой кнопкой мыши (Рис. 15 п. 1) и нажмите выбрать (2):

Рисунок 15.

Антибиотикам можно поставить значение "Не используется" (Рис. 15 п. 3), тогда они будут скрыты для выбора. Просмотреть справочник вместе со скрытыми элементами можно при установлении галочки "Отобразить неиспользуемые" (Рис. 15 п. 4).

Так же в табличной части можно указать пограничные значения МПК или значения диаметра зон подавления роста (Рис. 16 п. 1), тогда в протоколе микробиологического исследования, указанные значения будут проставляться автоматически. Данный функционал опционален, чувствительность в протоколе можно указывать и в ручном режиме. 

Рисунок 16.

У антибиотиков можно поставить галочку "По умолчанию" (Рис. п. 2), таким образом при обнаружении организма, автоматически заполнится поле препаратов, к которым определяется чувствительность , а также установить индекс сортировки (Рис. п. 3) - в каком порядке будут идти в протоколе лабораторного исследования в табличной части с антибиотиками.

На вкладке "Общие антибиотики организмов входящие в эту категорию" можно указать антибиотики сразу для всей таксономической категории:

Рисунок 17.

*Сопоставление с федеральными справочниками

Помимо стандартного сопоставления с федеральными справочниками (инструкция по сопоставлению):

• вид исследования
• услуга федеральная
• биоматериал, услуга по сбору биоматериала, кол-во и контейнер
• единицы измерения
  
  для документов микробиологической лаборатории необходимо дополнительное сопоставление:
• способов выполнения исследования
• НСИ БАК
• микроорганизмов
• антибиотиков
  

*1. Способы выполнения исследований 

Чтобы открыть справочник "способы выполнения лабораторных исследований" нажмите Справочники (Рис. п. 1), Лаборатория (Рис. п. 2), Исследования (Рис. п. 3), Способ выполнения лабораторных исследований (Рис. п. 4):

Рисунок .

Для того, что бы добавить новый элемент нажмите на плюс (Рис. п. 1). В открывшейся форме введите Наименование (Рис. п. 2), Лаборатория (Рис. п. 3), и сопоставьте со справочником методов определения чувствительности в поле БАК НСИ (Рис. п. 4)

Рисунок .

Для сопоставления выберите метод левой кнопкой мыши (Рис. п. 1) и нажмите "Выбрать" (Рис. п. 2)

Рисунок .

*2. НСИ БАК

Откройте параметр, последовательно выбрав в справочнике исследований анализ (Рис.  п. 1), исследование (Рис.  п. 2), параметр (Рис.  п. 3), в параметре перейти на вкладку «НСИ БАК» (Рис.  п. 1)

Рисунок . 

Необходимо сопоставить со справочником лабораторных тестов на обнаружение микроорганизмов в поле "НСИ обнаружение" и "НСИ идентификация"

Рисунок .

В поле, в котором хотите заполнить сопоставление, нажмите на многоточие (Рис. п. 1), после это в открывшемся справочнике лабораторных тестов на обнаружение микроорганизмов (https://nsi.rosminzdrav.ru/dictionaries/1.2.643.5.1.13.13.99.2.1133/passport/1.1) выберите необходимое значение левой кнопкой мышки (Рис. п. 2) и затем нажав выбрать (Рис. п. 3)

Рисунок .

*3. В микроорганизме должно быть указано сопоставление с НСИ:

Перейдите на вкладку "Микроорганизмы" (Рис. п. 1), выберите микроорганизм, который хотите настроить левой кнопкой мыши (Рис. п. 2) и нажмите на лупу (Рис. п. 3)

Рисунок .

Откроется карточка микроорганизма:

Рисунок 15.

*4. В антибиотиках должно быть настроено (Рисунок 17):

- Сопоставление

- Способ выполнения

- НСИ

- Стандарт определения чувствительности по умолчанию

Рисунок .

* 5.Синхронизация справочников с НСИ

Синхронизация справочника с НСИ производится следующим образом: Справочники – Произвольные таблицы – Справочник пользовательских значений (Рис. 19.).

Рисунок .

По кнопке «Действия» выбрать из выпадающего меню пункт «Загрузить из НСИ Росминздрава» (Рис. 20)

Рисунок .

В открывшемся окне необходимо выбрать обновляемый справочник. Для этого можно воспользоваться поиском или кнопкой «Выбрать». Если в выпадающем меню выбрать пункт «Лаборатория», то обновятся все федеральные справочники, используемые в ЛИС (Рис. 21).

Рисунок .

*

2.  Работа с документами.

Модуль микробиологической лаборатории использует два основных документа: направление на лабораторное исследование (далее направление) и результат лабораторного исследования (далее результат). Направление оформляется стандартно, более подробно этот процесс описан в инструкции тут.

Результат заполняется иначе, не так как в КДЛ. Это связано с федеральными требованиями к структуре протокола микробиологического исследования, которые отличаются от требований к структуре протокола исследования КДЛ.

Для внесения результатов исследований сотруднику лаборатории следует открыть журнал направлений: Документы – Лаборатория – Направления на исследования (Рис. )

Рисунок 30.

Рисунок 31.

Если у пользователь бактериологическая лаборатория указана в настройках пользователя как основная, то журнал направлений откроется сразу с установленным фильтром по этой лаборатории (Рис. ).  Для поиска направлений можно воспользоваться фильтрами, например, строкой поиска - найти направление по фамилии пациента или номеру документа, отобрать направления за определенную дату - как по дате создания направления, так и по дате, на которое назначено исследование (Рис. ),по определенному анализу или по врачу, который его назначил:

Рисунок 32.

Рисунок 32.

Также в журнале направлений документы можно сортировать на выполненные "отработанные" или невыполненные "Очередь", или посмотреть все:

Рисунок 34.

 Найденное направление следует открыть двойным щелчком мыши и нажать кнопку «Результаты» (Рис.23).

Рисунок 35.

Если результат уже был внесён ранее, то откроется заполненный протокол лабораторного исследования. В противном случае появится сообщение системы «Анализ ещё не выполнен. Хотите внести результаты?». После ответа «Да» откроется электронная форма протокола лабораторного исследования (Рис. 24).

Рисунок 36.

Шапка протокола содержит:

Рисунок 37.

1. Информация о пациенте.

2. Номер протокола лабораторного исследования. Обязательное поле. Заполняется автоматически, но может редактироваться вручную.

3. Дата и время создания протокола в ЛИС. Обязательное поле. Заполняется автоматически, но может редактироваться вручную.
   

4. Исследуемый биоматериал. Заполняется автоматически. Можно изменить значение, если в настройках анализа указано несколько биоматериалов.
5. Дата окончания исследования – дата, когда исследование было переведено в статус «Завершён». Заполняется автоматически, но может редактироваться вручную.
6. Ссылка на анализ в справочнике организации.
7. Ссылка на направление. Обязательное поле. Заполняется автоматически, но может редактироваться вручную.
8. Указывается исполнитель исследования. Обязательное поле. Заполняется автоматически данными пользователя, создавшего документ. Может редактироваться вручную. Для этого нужно нажать на три точки – откроется справочник медицинского персонала. Из справочника следует выбрать исполнителя исследования.
9. Оборудование – оборудование, которое было использовано при обнаружении роста колоний, заполняется автоматически при импорте результатов с анализатора, так же есть возможность ручного выбора анализатора из справочника «Оборудование медицинской организации» нажатием на "...".

10. Признак «Производственное исследование». Устанавливается, если исследуется не биоматериал пациента, а, к примеру, смывы. При установке данного признака из протокола удаляется информация о пациенте и ссылка на направление.

11. Статус исследования. При идентификации микроорганизма и определении антибиотикочувствительности меняется автоматически. Может быть изменён вручную. Исследование считается полностью выполненным, когда пользователь поставит статус «Завершён». Без этого статуса исследование не считается выполненным и врач, назначивший исследование, не видит результат, даже если результат подписан. Обязательно нужно ставить статус «Завершён».
    

Заполнения протокола при обнаружении микроорганизмов:

Рисунок 38.

1. Из выпадающего списка выбирается значение наличия роста колоний. При выборе любого значения, кроме «Рост есть» табличные части микроорганизмов и антибиотиков блокируются для заполнения (Рис. )
   

   Рисунок 39.

2. Кнопка добавление микроорганизма в протокол.

3. Код пробы указывается при наличии интеграции с анализатором для выгрузки результатов. При отсутствии интеграции заполнять код пробы не обязательно.

4. Указывается дата идентификации микроорганизма. Дата заполняется автоматически, но может редактироваться вручную.

5. Наименование обнаруженного микроорганизма. Наименование – микроорганизм выбирается из справочника «Микроорганизмы» (8) двойным щелчком по нужной позиции или добавляется из справочника микроорганизмов кнопкой "Плюс" (2). Если в настройках параметра исследования у микроорганизма установлен признак «По умолчанию» (см. п.1.3 Справочники бактериологии), то при установлении положительного статуса роста в протокол он добавится автоматически.

6. Степень роста -выбирается из списка, который настраивается в параметре, либо заполняется в произвольной форме.

7. Оборудование – указывается оборудование, которое было использовано при идентификации микроорганизмов, заполняется автоматически при импорте результатов с анализатора либо может быть выбрано вручную из справочника «Оборудование медицинской организации» нажатием на "...".

8. Поиск микроорганизмов в справочнике 8

Сокращённое отображение справочника микроорганизмов для быстрого добавления в табличную часть 12. Добавление происходит двойным кликом по нужной строке. Список отображаемых микроорганизмов можно настроить в свойствах параметра.

Для каждого микроорганизма будет показываться своя табличная часть для заполнения антибиотикочувствительности, переключается при нажатии на микроорганизм:

Рисунок 40.

Заполнение антибиотикочувствительности:

Рисунок 41.

1. Добавление антибиотика из справочника, если у препарата установлен признак «По умолчанию», в настройках микроорганизма, то в табличную часть он попадёт автоматически.
2. Дата дата проведения антибиотикочувствительности, заполняется автоматически, но может редактироваться вручную.
3. Наименование препарата, согласно справочника антибиотиков.
4. R-I-S – значение чувствительности выбирается из списка, который настраивается в справочнике «Чувствительность к антибиотикам».
5. Концентрация антибиотика, при настройке в карточке антибиотика пограничных значений МПК, при внесении значения автоматически определится чувствительность
6. Диаметр зоны подавления при настройке в карточке антибиотика пограничных значений пограничных зон подавления, при внесении значения автоматически определится чувствительность
7. Метод определения чувствительности
   
8. Оборудование – оборудование, используемое при определении антибиотикочувствительности, заполняется автоматически при импорте результатов с анализатора либо может быть выбрано вручную из справочника «Оборудование медицинской организации» нажатием на "...".
9. Стандарт определения чувствительности
10. Групповое заполнение антибиотикочувствительности для всех микроорганизмов в табличной части 16.
11. Поиск антибиотиков в справочнике (12)

Сокращённое отображение справочника антибиотиков для быстрого добавления в протокол. Добавление происходит двойным кликом по нужной строке. Список отображаемых антибиотиков можно настроить в свойствах микроорганизма. 


Внизу документа находятся кнопки:

Рисунок 42.

1. Импорт результатов с анализатора – при настроенной интеграции с прибором, происходит выгрузка данных в соответствии с кодом пробы (11)

2. Печать – осуществляется печать документа. После нажатия на кнопку открывается окно выбора печатных форм. Можно выбрать одну или несколько форм для печати.

3. Подписать и закрыть – кнопка сохраняет, устанавливает подпись на документ (ЭП при её наличии) и закрывает документ.

4. Сохранить и закрыть – кнопка сохраняет и закрывает документ, не устанавливая подпись. Исследование без подписанного результата не считается выполненным, такой документ недоступен врачу для просмотра.

5. Сохранить - кнопка сохраняет документ, но оставляет его открытым.

6. Закрыть – кнопка закрывает документ.
   
   Для удаления микроорганизмов или антибиотиков из протокола необходимо выбрать элемент, который нужно удалить и нажать:Рисунок 43.

Если на компьютере пользователя не установлено ЭП, то при подписании документа, устанавливается виртуальная подпись. Это говорит о том, что пользователь проверил корректность результата и утвердил его. Неутверждённые результаты исследований (без подписи) доступны для просмотра только сотрудникам лаборатории и пользователям с расширенными правами. Утверждённые результаты, доступны всем. Многие интеграционные сервисы требуют наличия ЭП на протоколах лабораторных исследований, Утверждённые результаты без ЭП не будут отправлены в такие сервисы, но будут доступны сотрудникам внутри организации.
Готовые протоколы лабораторных исследований находятся в журнале "Результаты бактериологических исследований" 

Рисунок 44.

3. Отчеты

Для проверки корректности заполнения справочников для формирования 256 СЭМД, существует отчет:

DAN.0064 версия 1 "Отчёт для проверки требований СЭМДов (справочники бак.)"

Для проверки соответствия уже созданных протоколов бактериологической лаборатории можно воспользоваться отчетом:

DAN.0065 версия 1 "Отчёт для проверки требований СЭМДов (документы бак.)"

4. Анкета